एस्टोनिया को अक्सर एक धर्मनिरपेक्ष समाज के रूप में देखा जाता है, जिसका अर्थ है कि सामान्य राज्य और सार्वजनिक जीवन में धर्म की भूमिका आम तौर पर सीमित है। इसका यह अर्थ नहीं है कि धार्मिक विश्वास, अनुष्ठान या विरासत अनुपस्थित हैं। ईसाई धर्म ने एस्टोनिया की इमारतों, कैलेंडर, कला, संगीत, कब्रिस्तानों और ऐतिहासिक शब्दावली को आकार दिया है। लूथरन परंपराएँ देश के जर्मन और नॉर्डिक ऐतिहासिक प्रभावों से गहराई से जुड़ी हैं। ऑर्थोडॉक्स ईसाई धर्म भी धार्मिक जीवन का एक महत्वपूर्ण हिस्सा है। विभिन्न ऑर्थोडॉक्स समुदायों में एस्टोनियाई-भाषी और रूसी-भाषी विश्वासी शामिल हैं, और उनके चर्चों, आइकनों, भजनों, उपवास परंपराओं और त्योहारों के रूप अलग-अलग हैं। अन्य समुदायों में कैथोलिक, बैपटिस्ट और अन्य प्रोटेस्टेंट, यहूदी, मुस्लिम, बौद्ध, प्रकृति-आधारित आध्यात्मिकता के अनुयायी और मिश्रित धार्मिक प्रथाओं वाले लोग शामिल हैं। उनका आकार और दृश्यता स्थान के अनुसार अलग-अलग होती है। कई निवासी स्वयं को गैर-धार्मिक, अनिश्चित, औपचारिक सदस्यता के बिना आध्यात्मिक या किसी परंपरा से सांस्कृतिक रूप से जुड़ा हुआ बताते हैं। कोई व्यक्ति क्रिसमस मना सकता है, किसी कब्र पर जा सकता है या किसी चर्च में प्रवेश कर सकता है, बिना विश्वासों के पूरे समूह को स्वीकार किए। अंतरात्मा की स्वतंत्रता किसी धर्म का पालन करने, उसे बदलने या किसी धर्म को न मानने के अधिकार की रक्षा करती है। सम्मानजनक सह-अस्तित्व के लिए यह आवश्यक है कि विश्वास या अविश्वास को बहिष्कार का कारण न माना जाए। धार्मिक आयोजनों के अपने नियम और लय होती है। पहनावे, भोजन, प्रार्थना, पवित्र वस्तुओं, फोटोग्राफी और भागीदारी के तरीके अलग-अलग हो सकते हैं, इसलिए अनुमान लगाने के बजाय विनम्रता से पूछना बेहतर है। धर्म समुदाय, नैतिक मार्गदर्शन, देखभाल, संगीत, अनुष्ठान और जीवन की महत्वपूर्ण घटनाओं के दौरान सहायता प्रदान कर सकता है। जब अधिकार, पहचान या सार्वजनिक मूल्यों को अलग-अलग ढंग से समझा जाता है, तब यह असहमति भी पैदा कर सकता है।
धर्म — एस्टोनिया में
एस्टोनिया में धर्म ऐसे समाज में मौजूद है जहाँ बहुत से लोग नियमित रूप से किसी धार्मिक संगठन से संबंधित नहीं होते या उसमें भाग नहीं लेते। लूथरन और ऑर्थोडॉक्स ईसाई परंपराएँ विशेष रूप से दिखाई देती हैं, जबकि अन्य आस्थाएँ और गैर-धार्मिक विश्वदृष्टियाँ भी मौजूद हैं। धार्मिक पहचान व्यक्तिगत, सांस्कृतिक, पारिवारिक या भाषा और समुदाय से जुड़ी हो सकती है।
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