主要保护冲突涉及森林砍伐、土地转为牧场、农业扩张、非法伐木、非法占地、野生动物贩运、偷猎、淘金、道路和水电项目提议、不可持续捕鱼以及海岸污染。对于里奥普拉塔诺和莫斯基蒂亚、加勒比海海洋与海岸带，以及干旱森林和太平洋地区，这些问题尤其敏感。联合国教科文组织的评估指出，需要系统执法、更明确的土地权属和使用安排、分区管理、综合发展、共同管理（comanejo）和共享决策。社区、原住民和洪都拉斯非裔群体、市政府、非政府组织及私人主体可通过共同管理和其他协议参与。参与本身并不会产生不受限制的资源使用权：保护区法令、分区规定、规划、许可、配额和禁渔期仍然适用。应避免并报告非法采掘、火灾和森林砍伐，可联系ICF地区办公室、SIGMOF预警系统以及相关市级或社区渠道。
洪都拉斯的自然环境
洪都拉斯的自然环境包括热带雨林、云雾林、干旱林、红树林、湿地、珊瑚礁、海草床、河流和稀树草原，以及相互联系的物种和自然过程。洪都拉斯国家保护区系统（SINAPH）共有93个保护区，分属17种管理类别，覆盖约511万公顷陆地和海域；受保护陆地约占全国面积的28%。ICF、SERNA及地方和社区合作伙伴通过因地制宜的规划和许可来管理保护、可持续利用、研究和公众进入。火灾、干旱、风暴、洪水、滑坡、海岸变化、生境丧失、非法采掘和污染都会影响这些地方的使用方式。
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